AGAの主な原因は、遺伝や男性ホルモンの影響と考えられています。男性ホルモンの1つ、テストステロンは、頭皮にある5α還元酵素という酵素と結びついてジヒドロテストステロン(DHT)へ変換されます。このDHTが髪の毛の発毛を阻害してしまう元凶です。DHTが毛乳頭や毛母細胞にヘアサイクルを乱すような指示を出し、髪の毛が短く細くなっていきます。

FAGAの主な原因は、加齢やストレスなどのホルモンバランスの乱れが原因と考えられています。男性ホルモンが起因することもあるため、男性のうす毛であるAGAの女性版で、FAGA（女性型脱毛症）とも呼ばれます。 女性特有の頭髪が全体的に薄くなる脱毛症で、初期では抜け毛が増え、分け目が広がり、やがて頭部全体の毛が抜けて薄くなります。